Aguatop Ltda se encuentra certificada bajo la norma ISO 9001 desde el año 2007.Actualmente posee la certificación ISO 9001:2008.
La norma ISO 9001:2008 es una norma internacional que tiene como objetivo fundamental, que las organizaciones que ofrecen productos y servicios adopten un enfoque basado en procesos, cuando este enfoque se desarrolla, implementa y adecua a través del funcionamiento de un Sistema de Gestión de la Calidad, este último sirve como una herramienta para cumplir con la satisfacción del cliente, a través del cumplimiento de sus requisitos.